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清華精儀系團(tuán)隊實現(xiàn)高分辨生物分子異構(gòu)體分析研究

研究背景與成果


生物分子的結(jié)構(gòu)解析與相關(guān)生物學(xué)功能的關(guān)聯(lián)研究已成為現(xiàn)今生命科學(xué)的前沿。生物分子存在多級結(jié)構(gòu),而其結(jié)構(gòu)復(fù)雜度的一個重要因素為分子異構(gòu)。不同的異構(gòu)分子(Isomers and isoforms)具有相同的化學(xué)式和分子量,但化學(xué)結(jié)構(gòu)不同。例如,單糖存在多種異構(gòu)體,包括葡萄糖、果糖、半乳糖等;多糖由單糖兩兩通過糖苷鍵相互連接組成,導(dǎo)致出現(xiàn)更為復(fù)雜的構(gòu)造異構(gòu)(分子中原子或原子團(tuán)互相連接次序不同,Structural or constitutional isomers)和立體異構(gòu)現(xiàn)象(連 接 次 序 相 同 但 空 間 排 列 不 同,Spatial isomers or stereoisomers)。


離子遷移(Ion mobility, IM)與質(zhì)譜(Mass spectrometry, MS)聯(lián)用(IM-MS)分析已經(jīng)發(fā)展為生物分子特別是生物大分子結(jié)構(gòu)解析的一種主要手段,并成為質(zhì)譜儀器發(fā)展的主要方向。IM可以區(qū)分MS不能區(qū)分的異構(gòu)體或同重素(Isobars),這一獨到的特性對生物分子的結(jié)構(gòu)解析研究十分關(guān)鍵,近年來被廣泛用于糖結(jié)構(gòu)、脂質(zhì)結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和活性、蛋白質(zhì)-分子相互作用等研究中。近年來,多種IM 分析方法被紛紛提出,例如遷移時間 DTIMS (Drift time ion mobility spectrometry)、囚禁式 TIMS(Trapped ion mobility spectrometry)、行波 TWIMS(Travelling wave ion mobility spectrometry) 以及非對稱場 FAIMS(Field asymmetric ion mobility spectrometry)等。然而,這些技術(shù)均基于低E/N場原理(E/N < 30 Td,E代表電場場強(qiáng),N代表中性氣體數(shù)密度,Td是Townsend數(shù)),分離分辨率一般在40-200,不足以解決目前生物分子異構(gòu)體解析研究的迫切需求。


圖1. 離子云掃描分析技術(shù)的儀器設(shè)置、原理和性能表征。(a)Mini β質(zhì)譜儀器系統(tǒng)。(b)實驗裝置示意圖。(c)離子云掃描技術(shù)原理。強(qiáng)迫振動下的兩種異構(gòu)體離子(紫色和藍(lán)色)的離子軌跡。(d)獲得的離子云掃描譜圖。


針對以上難題,清華大學(xué)精密儀器系生物醫(yī)學(xué)儀器與應(yīng)用研究團(tuán)隊向高E/N場尋求突破離子遷移分析低分辨率的局限,提出一種超高場離子云掃描技術(shù),并在Mini β質(zhì)譜儀器系統(tǒng)(PURSPEC科技(北京)有限公司)上實現(xiàn)遷移分辨率超過10,000的高分辨IM分析,提升較現(xiàn)有技術(shù)水平一個數(shù)量級以上(圖1)。超高場離子云掃描技術(shù)采用強(qiáng)迫振蕩的物理原理,在超高場(約1×105 Td)條件下實現(xiàn)異構(gòu)體離子的離子云分離,通過掃描激發(fā)振蕩電壓可以獲得異構(gòu)體離子的高分辨IM譜圖。


成果優(yōu)勢


利用高場離子云掃描分析技術(shù),對四種二糖異構(gòu)體 (海藻糖、麥芽糖、纖維二糖和乳糖,圖2a)開展了結(jié)構(gòu)分析(圖2b),并對乳糖和纖維二糖的混合物進(jìn)行了離子云掃描分析(圖2c),并與傳統(tǒng)串聯(lián)質(zhì)譜分析(圖2d)結(jié)果對比。從圖2d可見,乳糖和纖維二糖具有到相同的碎裂模式,無法通過串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)加以區(qū)分。但這兩種異構(gòu)體可以通過離子云掃描實現(xiàn)完全分離(圖2c)。此外,離子云掃描分析技術(shù)也展現(xiàn)出優(yōu)異的定量分析特性(圖2e和2f)。


圖2. 二糖異構(gòu)體分析。(a)四種二糖異構(gòu)體及其(b)離子云掃描譜圖。乳糖和纖維二糖混合物的(c)離子云掃描譜圖和(d)串級質(zhì)譜分析譜圖。(e)兩種二糖標(biāo)準(zhǔn)品及(f)混合物的定量分析結(jié)果。


離子云掃描技術(shù)對各類生物分子異構(gòu)體具有普遍適用性。如圖3所示,該技術(shù)同樣可分辨脂質(zhì)和多肽分子異構(gòu)體。研究工作中,離子云掃描方法展現(xiàn)出多種優(yōu)點,如分析部件結(jié)構(gòu)簡單、操作方便、具有強(qiáng)大的時間/空間串級質(zhì)譜能力等,可以方便地與多類質(zhì)量分析器聯(lián)用,用于設(shè)計混合型串聯(lián)分析質(zhì)譜儀器,在生物分子復(fù)雜結(jié)構(gòu)解析上展現(xiàn)出較好的應(yīng)用前景。


圖3. 脂質(zhì)與多肽異構(gòu)體分析。(a)脂質(zhì)異構(gòu)方式示意圖。各種脂質(zhì)異構(gòu)體的離子云掃描譜圖:(b)sn異構(gòu)、(c)碳碳雙鍵位置異構(gòu)和(d)雙鍵順反異構(gòu)。(e)多肽的不同翻譯后修飾類型及其異構(gòu)方式示意圖。不同翻譯后修飾類型的多肽異構(gòu)體離子云掃描譜圖:(f)甲基化、(g)乙?;停╤)磷酸化。


本研究由國家自然科學(xué)基金項目和清華大學(xué)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)科研項目資助。論文第一作者為清華大學(xué)精儀系周曉煜副教授,通訊作者為歐陽證教授,其他作者還包括精儀系博士生王卓凡和范菁津,第一完成單位為清華大學(xué)精密儀器系精密測試技術(shù)與儀器國家重點實驗室。這項研究也得到了清華大學(xué)化學(xué)系瑕瑜教授、精儀系馬瀟瀟副教授與張文鵬助理教授的大力幫助。


論文鏈接:

https://www.nature.com/articles/s41467-023-37281-7

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